言語学者のマイロ・サッチが、世界で指折りの地質学者や探検家を率いて、全長300メートルの巨大な潜水艦に乗り込み、遥かなる海底の旅に出る。彼らの使命は、失われた帝国アトランティスを発見すること。しかしその使命が、アトランティスを探すことから守ることに変わり、事態は思わぬ展開に…。海流のごとく目まぐるしく敵味方が変わる中、マイロが信頼できる人物は一体誰なのか