国民の魂と引き換えに完全な存在になろうとする最大の敵、国家中枢に潜むホムンクルスの生みの親“お父様”。エドとアルは仲間とともにその陰謀を立ち向かう!全ての鍵を握る父親・ホーエンハイムが語る“約束の日”、そして兄弟が出した最後の答えとは?